Nguyên nhân tồn 2,599 tỷ đồng tiền dịch vụ môi trường rừng chủ yếu là do hồ sơ giao đất, giao rừng chưa bảo đảm các điều kiện, như: diện tích rừng đang tranh chấp; giao chồng lấn diện tích giữa các chủ rừng trong huyện với chủ rừng của huyện khác và chồng lấn diện tích với tỉnh khác; sai khác thông tin và còn thiếu; chưa bàn giao quyết định, bản đồ giao đất, giao rừng về quỹ; chủ rừng tranh chấp, chồng lấn diện tích; chủ rừng chết, đi tù...
Riêng với phần diện tích rừng chưa đủ điều kiện chi trả ở huyện Nậm Pồ là do bản đồ giao đất, giao rừng của huyện Nậm Pồ chưa bảo đảm đúng theo Hướng dẫn số 239/HDLN-STNMT-SNNPTNT ngày 16/2/2022.
Được biết toàn bộ số tiền 2,599 tỷ đồng chưa đủ điều kiện chi trả là của 362 chủ rừng (với tổng diện tích 1.889,7260ha) trên địa bàn 9 huyện và thành phố.